1928年3月1日，在日本少壮军官团体“木曜会”的内部会议上，一群日本陆军的参谋达成了有关“满蒙问题”的共识。

1、满洲、蒙古问题对日本的未来生存至为重要。

2、满蒙于中国本为“化外之地”，未来中日之间必有“赌上国运”的一战，必须先取得满蒙以削弱中国。同时获得对苏联作战的资源地。

3、日本与美国之间必有一战，取得满蒙时当排除美国之干预，为未来对美作战做好充分的军事面准备。

这个赤裸裸的对中国进行侵略的方案很快被付诸实施。1931年9月18日夜晚10时20分左右，在东北奉天（今沈阳）柳条湖段的南满洲铁路上，发生了一起日本关东军自导自演的爆炸案。第二天，驻东北的日本关东军迅速占领了奉天、营口、长春等东北主要城市，日本陆军的“满蒙问题解决案”终于变成现实。这就是震惊中外的“九一八事变”，也称“满洲事变”、“柳条湖事变”。

11月10日，在关东军特务机关长土肥原贤二的一手策划下，清朝废帝溥仪从天津出发，并于13日抵达营口。1932年3月1日，溥仪在日军的扶植下于东三省建立起了一个伪满洲国傀儡政权。

对于九一八事变的发生和伪满洲国的建立，章太炎一直给予极大的关注。在九一八事变爆发以后，他就与熊希龄、马相伯、李根源、沈钧儒、黄炎培、章士钊等发布联合通电，痛斥当局不抗日，要求“召集国民会议，产生救国政府”。

在日本要求国际社会承认满洲国的时候，章太炎写下了一篇《论满洲》，从学理上对日本的无理要求进行了驳斥。太炎先生认为，日本引用第一次世界大战后的所谓“民族自决”的理论，为其侵略满洲的意图张目，是完全站不住脚的。中国东北的土地上生活的并不只有满洲人，还又诸多的汉族和其他民族的同胞，如果要让满洲在中国东北割据建立国家，那么被日本侵占已久的朝鲜半岛也应该独立建国，因为朝鲜半岛的大部分住民都是朝鲜人，他们亡国的时间远比清朝长。

1936年的6月4日，章太炎在病中写下了他人生中最后一封长信，收信人为蒋介石，在信中，章太炎建议国民政府“非常之时，必以非常之事应之”，他提出了联共抗日的主张，是符合民族利益的明智之见。体现了一个革命家老而弥坚的革命气节和崇高的民族精神。