南宋早期的高宗、孝宗二帝对秘书省的藏书高度重视，曾亲临巡视。

高宗赵构是在绍兴十四年（1144）七月丙子这天，也就是在新建的秘书省落成后第二年的日子，亲自驾幸秘书省阅书，王应麟在《玉海》卷二十七中是这样记载的：

高宗皇帝坐着车辇，在臣子的陪同下，到秘书省的道山堂走下车辇，召集臣子们观看前朝皇帝的御制御书、晋唐书画和三代古器。高宗这次前来是应游操等臣子的请求，他们的表文中说：万岁呀，秘书省已建造好，书籍也已整理好，入橱收藏了，请您务必抽时间来巡幸啊！

看完了这些御书和书画之后，高宗便步行来到右文殿。高宗看到右文殿的殿额，不免多看了几眼，随行的群臣说：这殿额是万岁亲笔所书，字写得真好。高宗一高兴，就在这里和大家坐了下来，对随从说：赐茶！

还将手中拿的那把扇子赐给了秘书省少监游操，说：你办这件事，劳苦功高，这把扇子就赐给你了，今天的天气真热呀！到了戊寅这一天，近臣拿了诏书来到秘书省，先是宣讲了皇帝口谕：我巡阅了秘书监，感到“秘府书籍尚少，宜广求访”。接着，近臣拿出皇帝的诏书，其中的两句话最重要：周建外史，掌三皇五帝之书；汉选诸儒，定九流七略之奏。秘书少监游操说：皇帝的口谕，切中要害，我们要加紧广为征书。

孝宗皇帝是在淳熙五年（1178）九月十二日这天巡幸秘书省的。孝宗先在右文殿受随行群臣朝拜，然后进入秘阁阅书，孝宗指着“秘阁”的榜额说：这两字也是太上皇亲笔所书，你们看老人家对秘书省多重视啊！进了秘阁先看累朝皇帝的御书，手持高宗写的《琴赋》这幅字对众臣说：这幅字写得多好！钟繇、王羲之写的也够不上这个水平！继而又在右文殿设宴，与群臣饮酒而罢。第二天写了一首诗，里面有“宴开芸阁，坐对蓬山”的句子，又有“稽古右文惭菲德，礼贤下士法先王”等语。秘书监收到孝宗的诗，当然十分慎重地保存在御制御书这个橱中了。